高亚教授担任中华医学会小儿外科分会副主任委员、小儿肛肠学顾问,中国抗癌协会儿童肿瘤专委会副主任委员,陕西省小儿外科分会主任委员,陕西省儿童外科疾病临床研究中心主任,陕西省小儿外科质量控制中心主任。同时,他还是小儿肿瘤组成员,陕西省小儿外科学会副主任委员,中国发明协会陕西分会会员,陕西省医疗事故鉴定专家,中华小儿外科分会常务委员、肛肠组副组长,卫生部内镜专业技术考评委员会小儿内镜专家组常务委员,《中华小儿外科杂志》《中国微创外科杂志》《西安交通大学学报》(医学版)等6家专业杂志编委、Chin Med J审稿人。